畑の大豆を抜いて根っこを見てみると、根っこに数ミリメートルの瘤（こぶ）のようなものがいっぱいくっついています。これは根粒と呼ばれる器官で、この中に根粒菌（バクテリアの一種）という土壌微生物が住んでいます。根粒菌は大気中の窒素をアンモニアに変換し（窒素固定といいます）、植物の生育に欠かせない窒素を大豆に供給する働きをしています。この根粒菌は、マメ科植物だけが共生しています。「どうしてマメ科植物だけが根粒菌と共生するのか？」、「根粒はどのようにできるのか？」、「こぶは作らなくても植物に役に立つ微生物はいないのか？」など明確には解明されていません。その関係の謎解きは、遺伝子やゲノムといった最新の生命科学で研究が行われています。